雍正年间,南少林三十六房住持刘仁宣受方丈之命给皇上送密函,途中遭袭身亡。当年康熙帝将缴获倭寇的宝藏藏在南少林中,刘仁宣是受皇上之命将宝藏部分清单送往京城。
宝亲王弘历受雍正之命前往浙江海宁以寻医为名暗访倭寇内应,弘历途中遇吕四娘袭击。吕四娘父亲吕留良当年被雍正所杀,吕四娘女扮男装陆弘十找到当年父亲好友、“易神医”曹太虚杀弘历。
雍正派方世玉和北少林玄真继任三十六房住持和方丈,刘仁宣之死是师叔普照所为,他欲夺方丈之位和宝藏。
吕四娘要曹太虚和她一起报仇遭拒,与前来的弘历相遇,曹太虚趁机逃走。
吕四娘与弘历打赌,如自己用曹太虚最爱吃的狗肉将其骗出,弘历就与她进京城杀一个人,曹太虚被骗出,吕四娘与弘历相约广宁寺。
江浙总督府温荣玉为讨好弘历,将名妓小红安排给弘历,洽遇方世玉到府上求见,小红将求救纸条递给方世玉,方世玉与吕四娘将小红救出怡红院。
“陆公子”和曹太虚欲在广宁寺杀弘历,被方世玉救下,方世玉告别弘历继续前往北少林。
南少林三十六房剧照
普照一班人欲在方世玉茶中下药,被“陆公子”巧妙化解,“陆公子”对方世玉暗生情愫。
北少林内,方世玉见到玄真大师和他的徒弟云明,3人连同云惠一起前往南少林。
普照特来迎接,几次加害玄真,但玄真还是如期披上主持伽沙。
吕四娘师兄江南六侠之一白太官,追杀吕家仇人刘太3年,终将其人头祭在吕老先生坟前,与暗恋多年的吕四娘相会。
弘历回京,他在江南时屡次听到“往生极乐,天心月圆”,他询问雍正被拒绝。因倭寇猖獗,雍正再次派弘历前往海宁。